Khan Noonien Singh è stato uno dei superuomini che, tra il
1992 e il
1996, hanno combattuto sulla
Terra le Guerre Eugenetiche. Ultimo ad essere sconfitto dopo quattro anni di aspri combattimenti, lui e i suoi trovano rifugio sul
Botany Bay e scompaiono al di fuori del Sistema Solare (
Space Seed).
La nave e il relativo equipaggio viene ritrovata dall'
Enterprise nel
2267.
In seguito al ritrovamento,
Kirk risveglia il capo, Khan appunto, che, dopo poco tenta di prendere il controllo dell'
Enterprise con l'aiuto dei suoi uomini.
Kirk, dopo aver posto Khan e i suoi sotto processo, lo condanna al confino su
Ceti Alfa V (
Space Seed).
Nel
2285 una squadra di sbarco della
Reliant, tratta in inganno dall'esplosione di
Ceti Alfa VI, scende su
Ceti Alfa V per alcune ricognizioni scientifiche, ignara dell'errore che sta commettendo. La squadra di sbarco viene catturata dal gruppo di Khan, che, dopo aver ottenuto informazioni sul progetto
Genesis e su
Kirk, prende possesso della
Reliant per vendicarsi di
Kirk (
Star Trek II).
